Metabolic Pathway Profiler (v4)

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available genomes

Ruminococcus albus_7, DSM 20455 (ncbi)
Ruminococcus callidus, ATCC 27760 (ncbi)
Clostridium acetobutylicum, ATCC 824 (ncbi)
Acetivibrio thermocellus, DSM 1313 (ncbi)
Syntrophomonas erecta, DSM 16215 (IMG)
Clostridium acetobutylicum, DSM 1731 (ncbi)
Acetivibrio alkalicellulosi, DSM 17461 (img)
Pseudobacteroides cellulosolvens, DSM 2933 (ncbi)
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei, Goettingen (IMG)
Paenibacillus guangzhouensis, KCTC 33171 (ncbi)
Ruminiclostridium herbifermentans MA18, DSM 109966 (ncbi)
Syntrophus buswellii, Sbus (IMG)
Syntrophomonas curvata, Scurva (IMG)
Syntrophomonas erecta sporosyntropha, Sespor (IMG)
Syntrophomonas wolfei methylbutyratica, Swm (IMG)
Terrisporobacter hibernicus, AnGL54 (ncbi)
FD-25-21, AnGL21 (ncbi)
Sunxiuqinia elliptica, AnGL22 (ncbi)
Paraclostridium benzoelyticum, AnGL27 (ncbi)
FD-MS-7-8, AnGL9 (ncbi)
FD-YE-37-9-3, AnGL29 (ncbi)
Methylobacterium radiotolerans, GTSA1 (ncbi)
Mucilaginibacter sabulilitoris, SNA2 (ncbi)
Syntrophomonas erecta, GB-438 (IMG)
Variovorax sp., EBFNA2 (ncbi)
Variovorax paradoxus, 2u118 (ncbi)
Dietzia cinnamea, 55 (ncbi)
Maridesulfovibrio salexigens, AnGL23 (ncbi)
Exiguobacterium mexicanum, AnGL24 (ncbi)
Priestia megaterium, 10L1 (ncbi)
Variovorax paradoxus, SPNA7 (ncbi)
Methanospirillum lacunae, Ki8-1 (IMG)
Geodermatophilus sp., RDM14 (ncbi)
Methylorubrum populi, CTY4 (ncbi)
Fictibacillus phosphorivorans, TY7 (ncbi)
Methanospirillum hungatei, GP1 (IMG)
Methanospirillum stamsii, Pt1 (IMG)
Syntrophomonas wolfei, saponavida (IMG)
Bacillus subtilis, 30VD-1 (ncbi)
Peribacillus frigoritolerans, 30N-5 (ncbi)
Micromonospora inositola, Utrum1 (ncbi)
Sphingomonas sp., CR2A3 (ncbi)
Terrisporobacter hibernicus, CB-LS-10-2 (ncbi)
Niallia taxi, AG-1 (ncbi)
Methanospirillum.hungatei GP1, MhGP1 (IMG)
Methanospirillum.hungatei.JF-1, MhunJF1 (IMG)
MPOB, Sfum (IMG)
Syntrophomonas palmitatica, JCM14374 Spalm (IMG)
Syntrophomonas wolfei (Swol), Goettingen.DSM2245B (IMG)
Syntrophomonas zehnderi, OL-4 Szehn (IMG)
Syntrophus aciditrophicus, SB (ncbi)
Syntrophus gentianae, DSM8423 (ncbi)
FD_25_22, AnGL7 (ncbi)
FD_25_27, AnGL8 (ncbi)
FD_MS_7_1, AnGL28 (ncbi)
FD_SO4_25_1_F22, AnGL30 (ncbi)
FD_SO4_37_1, AnGL2 (ncbi XH)
FD_YE_25_21, AnGL21 (ncbi)
FD_YE_37_3, AnGL26 (ncbi)
FD_YE_37_8_2, AnGL3 (ncbi)
FD_YE_37_9_2, AnGL4 (ncbi)
Clostridium subterminale, CB-LS10-1 (ncbi)
Mucilaginibacter gossypii, cycad 4 (ncbi)
[dbcan]
GHCBMCEGTPLSLHAAtotproteins#protein
6919126423,518
374 Paraclostridium benzoelyticum AnGL27
Overview Diamond CGC - CAZyme gene clusters HMMER HMMER sub

Overview

Columns are sortable
AnGL27_00425 -|-GH13_39(183-492)CBM34_e3+GH13_e89GH13_393
AnGL27_00426 2.4.1.1:158GT35(90-804)GT35_e0GT353
AnGL27_00427 2.4.1.21:9GT5(2-477)GT5_e9GT53
AnGL27_00430 2.4.1.18:57|2.4.1.18:14CBM48(29-113)+GH13_9(180-478)CBM48_e2+GH13_e200CBM48+GH13_93
AnGL27_00511 -CE4(28-144)CE4_e76CE43
AnGL27_00657 -GT28(233-384)GT28_e54GT283
AnGL27_00978 -CE4(68-192)CE4_e172CE43
AnGL27_00986 -CE4(49-173)CE4_e80CE43
AnGL27_01055 -GH38(6-258)GH38_e31GH383
AnGL27_01056 2.4.1.352:2GH13_18(86-428)GH13_e137GH13_183
AnGL27_01127 -GH25(7-184)GH25_e34GH253
AnGL27_01204 3.2.1.86:16GH4(6-185)GH4_e24GH43
AnGL27_01208 -CE9(5-370)CE9_e21CE93
AnGL27_01215 -GH73(73-212)GH73_e157GH733
AnGL27_01263 -GH23(52-175)GH23_e7GH233
AnGL27_01353 3.2.1.24:1GH38(241-510)GH38_e18GH383
AnGL27_01354 3.2.1.-:1GH38(5-274)GH38_e12GH383
AnGL27_01361 3.2.1.-:2GH125(19-415)GH125_e0GH1253
AnGL27_01362 3.2.1.86:10|3.2.1.85:2|3.2.1.21:1GH1(3-456)GH1_e13GH13
AnGL27_01364 3.2.1.96:3|3.2.1.96:2GH85(96-430)+CBM32(798-919)GH85_e0+CBM32_e223CBM32+GH853
AnGL27_01365 3.2.1.84:1GH31_1(230-669)GH31_e37GH31_13
AnGL27_01420 -GT51(116-278)GT51_e52GT513
AnGL27_01522 -GT1(236-414)GT1_e307GT13
AnGL27_01551 3.2.1.-:3GH73(588-725)GH73_e259GH733
AnGL27_01571 -CE4(62-176)CE4_e12CE43
AnGL27_01642 -GH73(147-286)GH73_e5GH733
AnGL27_01643 -GH129(427-755)-GH02
AnGL27_01778 -GH38(3-261)GH38_e8GH383
AnGL27_01846 5.4.99.11:5|3.2.1.20:4|3.2.1.10:1|3.2.1.-:1|3.2.1.70:1GH13_31(28-372)GH13_e122GH13_313
AnGL27_01932 -CE4(75-202)CE4_e314CE43
AnGL27_01939 3.2.1.14:2GH18(267-560)GH18_e83GH183
AnGL27_01952 -CE4(39-163)CE4_e195CE43
AnGL27_02039 -GT51(67-222)GT51_e165GT513
AnGL27_02060 -GH109(1-162)--1
AnGL27_02117 -GT2(112-338)GT2GT23
AnGL27_02180 3.2.1.23:35GH2(35-362)GH2_e1GH23
AnGL27_02181 3.2.1.23:12GH2(1-469)GH2_e61GH23
AnGL27_02279 -GH73(150-286)GH73_e5GH733
AnGL27_02335 -|-GT2(5-100)GT2+GT2GT23
AnGL27_02523 3.2.1.14:3|3.2.1.14:4GH18(54-460)GH18_e104+CBM5_e38CBM5+GH183
AnGL27_02560 -|-GT2(11-181)GT2+GT4_e2061GT2+GT43
AnGL27_02732 -AA4(10-251)AA4_e1-2
AnGL27_02797 -GT2(5-127)GT2GT23
AnGL27_02798 -|-GT2(4-132)+GT4(498-625)GT2+GT4_e3889GT2+GT43
AnGL27_02807 -GH3(111-336)GH3_e71GH33
AnGL27_02968 -GT28(200-341)GT28_e22GT283
AnGL27_02987 -CE4(108-229)CE4_e47CE43
AnGL27_02991 -GH113(38-322)GH113_e0GH1133
AnGL27_02993 -GT2(51-282)GT2GT23
AnGL27_03004 -GH170(3-354)GH170_e11GH1703
AnGL27_03050 -GH23(119-229)GH23_e506GH233
AnGL27_03066 -GT4(204-336)GT4_e3072GT43
AnGL27_03067 -GT4(184-329)GT4_e3212GT43
AnGL27_03083 -GT4(233-368)GT4_e3190-2
AnGL27_03086 -GT4(222-379)GT4_e1056GT43
AnGL27_03087 -GT4(184-330)GT4_e2643-2
AnGL27_03191 -GT2(6-125)GT2GT23
AnGL27_03258 -CE4(48-170)CE4_e238CE43
AnGL27_03294 -GT28(192-353)GT28_e1GT283
AnGL27_03346 -GT4(172-331)GT4_e1169GT43
AnGL27_03349 -GT4(148-286)GT4_e451GT43
AnGL27_03350 2.4.1.-:1GT2(6-135)GT2-2
AnGL27_03352 -GT2(4-114)GT2GT23
AnGL27_03409 -GT51(113-266)GT51_e52GT513
AnGL27_03607 -GT4(213-326)GT4_e1090GT43
AnGL27_03652 -|-GH13_39(183-492)CBM34_e3+GH13_e89GH13_393
AnGL27_03653 2.4.1.1:158GT35(90-804)GT35_e0GT353
AnGL27_03654 2.4.1.21:9GT5(2-477)GT5_e9GT53
AnGL27_00519 --CBM50_e151CBM502
AnGL27_01031 --AA2_e1Aspoch1_GeneCatalog_proteins_20140127.aa.fasta+AA02
AnGL27_01103 --GH23_e544GH232
AnGL27_02032 --GH73_e94GH732
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AnGL27_02559 --GT4_e2061GT42
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AnGL27_01147 ---Aspuda1_GeneCatalog_proteins_20160920.aa.fasta+GH711
AnGL27_01220 ---GT01
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AnGL27_01390 ---GT11
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AnGL27_01577 ---GT21
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AnGL27_01811 ---CBM501
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AnGL27_01970 ---GT41
AnGL27_02013 ---GH11
AnGL27_02124 ---CBM501
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AnGL27_02699 ---GH731
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AnGL27_03082 ---GT41
AnGL27_03085 ---GT01
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AnGL27_03215 ---Rhich1_GeneCatalog_proteins_20131210.aa.fasta+GT571
AnGL27_03263 ---Botdo1_1_GeneCatalog_proteins_20150128.aa.fasta+GT11
AnGL27_03295 ---GT1191
AnGL27_03309 ---GT21
AnGL27_03313 ---GH11
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AnGL27_03356 ---GH130_11
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AnGL27_03611 ---GH13_231
AnGL27_03613 ---GH13_311
AnGL27_03623 ---Pensub1_GeneCatalog_proteins_20160929.aa.fasta+GH1311
AnGL27_03628 ---GH131
AnGL27_03642 ---CE81

Diamond

Columns are sortable
AnGL27_00066 1319|Capep1_GeneCatalog_proteins_20160826.aa.fasta|GT4143.84323431104400333
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AnGL27_00134 WZL71508.1|GT442538153815120407
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AnGL27_00746 118117|Volvo1_GeneCatalog_proteins_20130703.aa.fasta|CE442.469611686103717290516
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AnGL27_00889 CUS04610.1|GT435.47581877437420487
AnGL27_00924 AWZ17133.1|GH13_3040.411275108440615050765
AnGL27_00950 7787|Pocchl1_GeneCatalog_proteins_20170916.aa.fasta|GH7136.471913177336810850444
AnGL27_00973 QUI22575.1|CBM50375925591346210408
AnGL27_00978 WGX76478.1|CE497.4270127012700523
AnGL27_00979 CAG7911095.1|GH5_1144903787357814680741
AnGL27_00986 QEZ68986.1|CE496.9254125412540482
AnGL27_01012 CCO12112.1|GH13_3166.9432142914320555
AnGL27_01031 504940|Aspoch1_GeneCatalog_proteins_20140127.aa.fasta|AA062.5734173317320951
AnGL27_01055 UDN55223.1|GH38788871886589101432
AnGL27_01056 UDN51736.1|GH13_1882.6564156415640962
AnGL27_01100 WZL71508.1|GT446.650015514155120426
AnGL27_01103 UOW68280.1|GH2395.8167116711670310
AnGL27_01127 QEZ68850.1|GH25941991199162140392
AnGL27_01137 455839|Hypcro1_GeneCatalog_proteins_20190611.aa.fasta|GH4738481846969811750347
AnGL27_01145 4608|Aspuda1_GeneCatalog_proteins_20160920.aa.fasta|GH714743817448254560407
AnGL27_01147 4608|Aspuda1_GeneCatalog_proteins_20160920.aa.fasta|GH7147.544013444254560402
AnGL27_01204 UOW68362.1|GH499.5436143614360859
AnGL27_01208 UOW68366.1|CE997.1376137613760714
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CGC - CAZyme gene clusters

transcription factors (TFs), transporters (TCs), signal transduction proteins (STPs), and CAZyme gene clusters (CGCs)

Columns are sortable
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