Small Microbes Pathway Profiler

Domain Counts
Profiler Search and BLAST
CAZy ▾
CAZyme Browser CAzy - DBCAN (original) CAZyme protein counts Proteome Coverage Summary
Search ▾
Text search Domain display search
Pathways ▾
Nitrogen Fixation CANT-Hyd
UMAP
◀ domain architecture  ·  operons  ·  ❔ guide
enter a locus id, or use ?gbid= / ?gene_oid=

Swg_02023

smpp Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei Goettingen
operons in this genome ▶  ·  domain architectures ▶  ·  reaction activity ▶
✕

Identity & position

Product
S-layer homology domain-containing protein
Gene
—
Location
NC_008346.1:2,272,385–2,274,262 (−)   625 aa
Keys
gbid 56239   gene_oid 638138872   TM×1

Domain architecture

SLH Pfam domain ▮ TM helix
Pfam signature: pfam00395,pfam00395,pfam00395

Putative operon (same contig + strand, gap ≤ 50 bp)

Monocistronic at this threshold — no co-oriented neighbour within 50 bp. try gap = 300 bp

Same architecture across genomes — proteins sharing this exact Pfam-domain signature

34 proteins across 8 genomes share architecture group #1046  pfam00395,pfam00395,pfam00395

GenomeLocusaaSP/TMPfam order
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei Goettingen Swg_01831 218 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei Goettingen Swg_01956 657 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei Goettingen Swg_02023 ◀ 625 TM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas curvata DSM15682 / GL#14 Scur_00234 490 SP pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas curvata DSM15682 / GL#14 Scur_00490 1035 pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas curvata DSM15682 / GL#14 Scur_00616 636 pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas curvata DSM15682 / GL#14 Scur_00679 659 SP pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta DSM 16215 / GB-438 Ser_01502 663 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta DSM 16215 / GB-438 Ser_01705 546 TM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta DSM 16215 / GB-438 Ser_01706 881 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta DSM 16215 / GB-438 Ser_02224 502 SP pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta sporosyntropha Sespor / JCM 13344 Sesp_00983 502 SP pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta sporosyntropha Sespor / JCM 13344 Sesp_01627 881 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta sporosyntropha Sespor / JCM 13344 Sesp_01628 546 TM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas erecta sporosyntropha Sespor / JCM 13344 Sesp_01823 663 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_00502 781 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_00523 303 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_00764 468 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_01176 396 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_01714 886 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_01922 259 pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_01964 657 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_02404 188 pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas palmitatica JCM14374 Spalm Spalm_02436 185 pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_01030 498 SP pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_01924 1037 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_02714 856 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_03238 444 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei methylbutyratica 4J5 Swm_02073 510 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei methylbutyratica 4J5 Swm_02234 657 TM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas wolfei methylbutyratica 4J5 Swm_02298 443 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn Szeh_00132 1804 TM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn Szeh_00202 654 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn Szeh_00704 1748 SPTM pfam00395,pfam00395,pfam00395
↑ Top




v1.00 @copyright 2026 UCLA