Small Microbes Pathway Profiler

Domain Counts
Profiler Search and BLAST
CAZy ▾
CAZyme Browser CAzy - DBCAN (original) CAZyme protein counts Proteome Coverage Summary
Search ▾
Text search Domain display search
Pathways ▾
Nitrogen Fixation CANT-Hyd
UMAP
◀ domain architecture  ·  operons  ·  ❔ guide
enter a locus id, or use ?gbid= / ?gene_oid=

Szeh_00962

smpp Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn
operons in this genome ▶  ·  domain architectures ▶  ·  reaction activity ▶
✕

Identity & position

Product
HNH endonuclease
Gene
—
Location
NZ_CGIH01000018.1:22,730–23,086 (+)   118 aa
Keys
gbid 1783976   gene_oid 2677388841  

Domain architecture

Pfam domain
Pfam signature: pfam01844

Putative operon (same contig + strand, gap ≤ 300 bp)

Szeh_00951 Szeh_00952 Szeh_00953 Szeh_00954 Szeh_00955 Szeh_00956 Szeh_00957 Szeh_00958 Szeh_00959 Szeh_00960 Szeh_00961 Szeh_00962 ◀ Szeh_00963 Szeh_00964 Szeh_00965 Szeh_00966 Szeh_00967 Szeh_00968 Szeh_00969 Szeh_00970 Szeh_00971 Szeh_00972 Szeh_00973 Szeh_00974 Szeh_00975 Szeh_00976 Szeh_00977 Szeh_00978 Szeh_00979 Szeh_00980 Szeh_00981 Szeh_00982 Szeh_00983 Szeh_00984 Szeh_00985 Szeh_00986 Szeh_00987 Szeh_00988 Szeh_00989 Szeh_00990 Szeh_00991 Szeh_00992 Szeh_00993 Szeh_00994 Szeh_00995   → reaction activity for this operon

Same architecture across genomes — proteins sharing this exact Pfam-domain signature

8 proteins across 6 genomes share architecture group #1200  pfam01844

GenomeLocusaaSP/TMPfam order
Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn Szeh_00962 ◀ 118 pfam01844
Syntrophomonas zehnderi OL-4 Szehn Szeh_02248 119 pfam01844
Syntrophomonas erecta DSM 16215 / GB-438 Ser_00785 119 pfam01844
Syntrophomonas erecta sporosyntropha Sespor / JCM 13344 Sesp_02565 119 pfam01844
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_00014 282 pfam01844
Syntrophomonas wolfei saponavida / SD2 Sws_02684 261 pfam01844
Syntrophomonas wolfei methylbutyratica 4J5 Swm_00285 118 pfam01844
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei Goettingen Swg_02231 274 pfam01844
↑ Top




v1.00 @copyright 2026 UCLA